华大基因植物基因组学案例研讨班        作为基因组计划的重要组成部分，植物基因组计划近年来已取得较大进展，相继完成了拟南芥、水稻、玉米、大豆等重要植物的基因组序列图谱绘制。在此基础上产生了一系列植物基因组研究的理论和方法，同时为作物种质资源的基因研究及分子育种探索提供了理论和方法基础。自华大基因启动“千种动植物基因组参考序列谱构建计划”和“千种植物转录组研究”以来，已完成水稻、黄瓜、马铃薯、白菜等植物的基因组序列图谱绘制，并通过对大豆的重测序研究建立了高密度分子标记图谱。为了使植物基因组学领域取得的研究成果更好地为研究人员利用，华大基因特举办植物基因组学案例研讨班。本期研讨班以最近几年华大基因在该领域发表的高水平文章及国际上的经典文章为案例，由华大基因的学术带头人与广大研究人员共同探讨植物基因组学的研究技术、研究方法及未来发展方向。本期案例研讨班是华大基因2011年唯一的一次与经典项目案例紧密结合，且优惠力度最大的专题研讨班，还等什么呢？快来加入吧！（马上报名）特别优惠：教授/研究员携带本单位学生参加，其中一名学生可享受5折优惠。（注：学生与教授/研究员同时参加时需提供学生证方可享受相应优惠。） 

主办单位：深圳华大基因研究院

培训地点：中国深圳

培训时间：2011年12月12日-2011年12月17日课程要点：

1、  植物基因组学研究进展

主要包括植物基因组学的研究思路、研究近况及未来的发展方向。

 

2、  植物基因组研究策略

主要包括全基因组de novo测序、全基因组重测序及转录组测序的研究策略。

 

3、  植物基因组的物理图谱构建及基因组信息的挖掘分析

应用到的分析技术：

基因组de novo组装——主要包括组装的原理、影响组装的因素及组装结果的评估

基因组注释和基因注释——传统的及RNAseq辅助的基因结构预测、基因功能的注释

经典案例：

The genome of the mesopolyploid crop species Brassica rapa.

Genome sequence and analysis of the tuber crop potato.

The genome of the cucumber, Cucumis sativus L.

 

4、  基因组序列在遗传进化上的研究

应用到的分析技术：比较基因组学和进化分析——全基因组线性分析、全基因组复制、系统进化树的构建经典案例：

Genome sequence and analysis of the tuber crop potato.

The genome of the cucumber, Cucumis sativus L.

Genome sequence of the palaeopolyploid soybean

 

5、 分子标记开发（基于群体遗传学分析）

应用到的分析技术：

群体遗传变异分析（包括SNP、SV、CNV、indel、PAV等）、分子标记

经典案例：

Resequencing of 31 wild and cultivated soybean genomes identifies patterns of genetic diversity and selection.

Genome-wide patterns of genetic variation among elite maize inbred lines.

 

6、  RNA水平的植物基因组研究

应用到的分析技术：

     植物转录组研究方法介绍——有参考基因的转录组和无参考基因的转录组

 植物小RNA及降解组研究方法介绍

经典案例：

Deep RNA sequencing at single base-pair resolution reveals high complexity of the rice transcriptome.

Global identification of microRNA–target RNA pairs by parallel analysis of RNA ends.

Deep sequencing identifies novel and conserved microRNAs in peanuts (Arachis hypogaea L.)

 

7、  基于植物基因组学研究的分子育种探索 培训特色:讲师团成员来自深圳华大基因研究院科研项目一线，实战经验丰富；理论技术与案例相结合，在案例剖析中领悟研究思路与方法；理论课与实践课相结合，讲师与学员研讨的方式进行； 报名方式：

本期注册费6800元。（马上报名）培训期间可免费提供工作餐，可协助安排住宿，住宿费用自理。联系电话：0755-25273851 刘老师E-mail：training@service.genomics.cn如有任何疑问请发邮件至training@service.genomics.cn